¿Sabes que es el BLUP?

admin1 Uncategorized Leave a comment

Gregor Mendel, considerado el padre de la genética

Ha pasado un año desde que no os puedo pasar a saludar personalmente por vuestra granja y ciertamente me siento molesto conmigo mismo. Digo molesto, dado que en su momento no pude despedirme de vosotros personalmente y agradeceros el preciado tiempo y paciencia que me dedicabais en cada una de las visitas que hacia. Mas pausado, lo hago ahora esperando aceptéis mis sinceras disculpas.

Dicho esto y pensando en algunas de las experiencias que intercambiamos, recuerdo que me quedé con la idea de que el concepto de BLUP nos sonaba a todos como algo muy habitual pero que en el fondo no acabábamos de tener muy claro y quedaba algo difuso su significado. 

En esta línea de trabajo y para salir un poco de mi ignorancia, os he encargado éste artículo que espero nos ayude a comprender la técnica BLUP utilizada en la selección genética porcina.

¿Sabes que es el BLUP?

 

Mejoramiento genético en poblaciones porcinas 

Con el pasar del tiempo, los investigadores en la industria de producción animal han buscado las mejores prácticas para lograr un aumento en la productividad de sus rebaños, esto es, obtener una población menos propensa a enfermedades, con mayor capacidad de reproducción y en líneas generales, un animal que brinde un producto de mejor calidad con el menor gasto posible.

Esto por supuesto no es fácil de conseguir, implica incursionar en el área del mejoramiento genético y para ello, se utilizan diferentes herramientas en el campo de la estadística que permiten analizar una gran cantidad de variables internas y externas de un grupo de animales del mismo tipo para así producir crías superiores a sus antecesores en aspectos físicos y de salud.

Entonces, si el objetivo es producir una raza superior de cerdos, la idea es utilizar un método estadístico que permita estudiar las diferentes variables disponibles como las características fenotípicas de la ascendencia del animal (morfología o rasgos físicos) tanto de la madre y el padre, así como, las medioambientales.

La metodología más relevante para la valoración animal 

Para estos casos se han utilizado varios métodos a lo largo del tiempo, pero el que ha tomado mayor importancia en los últimos años es “Mejor Predictor Lineal Insesgado” o por sus siglas en inglés BLUP, Best Linear Unbiased Prediction. Esta es una metodología usada en modelos lineales mixtos para la estimación de efectos aleatorios.

Vamos por partes, en la valoración genética animal se busca precisamente lo que comentaba antes, valorar los rasgos de un animal, teniendo en cuenta datos genealógicos del mismo, es decir, información de los padres o hermanos para así predecir cuál será el valor genético aditivo, o lo que es lo mismo, las características fenotípicas que tendrá la cría.

Antes de usar el BLUP era muy común la práctica de los índices de selección, por supuesto la informática no estaba muy desarrollada y por lo tanto era más complicada la resolución de un modelo mixto.

El índice de selección básicamente proporciona un estimador del valor genético aditivo del individuo a partir de datos disponibles del padre o del hermano. La desventaja en este caso es que el estudio sólo toma en cuenta información del padre y no de la madre por lo que la evaluación genealógica queda incompleta, además, sólo se puede realizar en un individuo a la vez.

Orígenes del BLUP 

La metodología no es nada nueva, de hecho, fue establecida en el siglo pasado, específicamente en 1970 y en un primer momento se aplicó al ganado vacuno, aunque actualmente se aplica a todas las poblaciones ganaderas.

El BLUP, al igual que la Regresión Lineal, se aplica mediante el método de mínimos cuadrados y a pesar de que ahora el uso práctico de la herramienta se ha generalizado, antes no era así por el alto costo que representaba utilizar un equipo informático para la aplicación del método, algo que no es un problema actualmente por el gran desarrollo de la tecnología en los últimos años.

Modelos BLUP existentes 

Dentro de la metodología BLUP, existen diferentes submodelos de acuerdo a la información disponible principalmente en los aspectos genealógicos, veamos cuales son:

  • Modelo Padre: donde se utiliza la conexión genética, los efectos del ambiente y fenotipos sólo de la genealogía paterna, por lo que no toma en cuenta efectos de consanguinidad ni tendencias genéticas al igual que no brinda valores de la madre. Útil cuando el proyecto no cuenta con información completa y hay pocos recursos.
  • Modelo de Grupo genético: emplea la conexión genética, fenotipos, efectos ambientales, genealogía paterna y clasifica a los machos por generaciones. Éste modelo si toma en cuenta las tendencias genéticas, pero no tiene en consideración la consanguinidad ni brinda valores de la madre. Es útil cuando se tienen pocos recursos, pero ya hay un progreso en la información genética disponible.
  • Modelo Abuelo Materno: usa la genealogía materna y paterna, tiene en cuenta los efectos ambientales, fenotipos, conexión genética pero aún no toma en cuenta la consanguinidad ni ofrece valores para la madre.
  • Modelo animal: es el de uso más extendido donde se considera la genealogía más completa posible, los efectos ambientales y fenotipos de varios caracteres. Este modelo brinda la mejor información de todos, tiene en cuenta los valores de la madre y ofrece datos de consanguinidad, así como la conexión genética. Su cálculo es más complejo y necesita datos muy completos, pero es el mejor modelo a utilizar si se tienen los recursos y la información totalmente disponible.

 

Las ventajas del BLUP

La ventaja que proporciona el método BLUP frente a otras metodologías es que se realiza a través de herramientas estadísticas computarizadas. Esto a la vez permite que el estudio pueda realizarse en animales con diferente información generacional, sexo, época y, además, pueden estudiarse animales de diferentes granjas siempre y cuando éstas estén bien relacionadas.

Al mismo tiempo, el método BLUP permite verificar la relevancia de los efectos ambientales en los sujetos como el régimen de alimentación, la crianza en determinada granja, entre otros factores.

Otra de las ventajas frente al índice de selección radica en que se utiliza toda la información de parentesco disponible del animal en forma simultánea al igual que se le asigna un valor genético a cada animal por separado (en los índices de selección, es asumido que todos los animales poseen el mismo valor genético).

Alejandra Tomassi

BLOGGER

 

 

Add a Comment

Uso de cookies y política de privacidad

Este sitio web utiliza cookies para que usted tenga la mejor experiencia de usuario. Si continúa navegando está dando su consentimiento para la aceptación de las mencionadas cookies y la aceptación de nuestra política de cookies y privacidad, pinche el enlace para mayor información.plugin cookies

ACEPTAR
Aviso de cookies